Dengan kapasitas 520 kursi, KA ini punya dua layanan, yaitu kelas eksekutif sebanyak empat gerbong, dan kelas ekonomi premium juga sebanyak empat gerbong.
KA Mutiara Timur tujuan Banyuwangi-Surabaya Gubeng dilakukan perubahan stamformasi (susunan rangkaian KA) menggunakan rangkaian New Image (Stainles steel).